Viele kirchliche Bibliotheken, sowohl der katholischen, als auch der evangelischen Konfession, verfügen in ihren Beständen über sehr viele Inkunabeln. Diese sind hier aufgelistet. Zur Vervollständigung sind auch Bibliotheken des deutschsprachigen Auslandes mit Inkunabeln aufgeführt.
(Die Zahlen am Anfang eines jeden Absatzes geben die Zahl der Inkunabeln an)
Österreich
530 Admont, Stift
191 Aigen, Stift Schlägl
150 Altenburg, Stift
17 Feldkirch, Diözesanbibl.
1110 Furth, Stift Göttweig
65 Geras, Stift
926 Graz, Franziskanerprovinz
400 Heiligenkreuz, Stift
205 Herzogenburg, Stift
410 Innsbruck, Servitenkloster
623 Klagenfurt, Diözesanarchiv Gurk
850 Klosterneuburg, Stift
630 Kremsmünster, Stift
140 Lambach, Stift
89 Lilienfeld, Stift
126 Linz, Kath.-Theol. Hochschule
750 Melk, Stift
3000 Michaelbeuern, Benediktiner-Abtei
320 Rein, Stift
102 Salzburg, Diözesanbibliothek
1000 Salzburg, Stift St. Peter
150 Salzburg, Franziskanerprovinz
800 Sankt Florian, Stift
134 Sankt Lambrecht, Stift
677 Sankt Paul, Stift
4000 Sankt Pölten, Diözesanbibliothek
35 Seckau, Benediktiner-Abtei
230 Seitenstetten, Stift
206 Vorau, Stift
438 Wien, Benediktiner-Abtei Schotten
200 Wien, Dominikaner
70 Wien, Erzbischöfliche Bibliothek
80 Wien, Priesterseminar
1 Wien, Salvatorianerkolleg
40 Wiener Neustadt, Stift Neukloster
306 Zwettl, Stift
Schweiz
360 Engelberg, Stift
162 Luzern, Kapuzinerprovinz
1000 Sankt Gallen, Stiftsbibliothek
45 Sarnen, Benediktinerkollegium
Italien, Südtirol
13 Bozen, Benediktiner (Muri-Gries)
122 Brixen, Kapuziner
244 Brixen, Priesterseminar
Luxemburg
15 Luxemburg, Priesterseminar